Głównym celem Oddziału Wczesnego Wspomagania Rozwoju Dzieci z Autyzmem i Pokrewnymi Zaburzeniami jest pomoc dzieciom z autyzmem oraz ich rodzinom w przezwyciężaniu skutków niepełnosprawności, dotykającej wszystkie dziedziny życia, poprzez zapewnienie wielostronnej, wielospecjalistycznej pomocy polegającej na diagnozie, terapii i edukacji. Szczegółowe cele i zadania pracy terapeutycznej Oddziału wynikają z możliwości, potrzeb i stopnia zaburzenia każdego dziecka. Oddział ma charakter monoterapeutyczny. Jedyną realizowaną w nim formą terapii jest terapia behawioralna. Działalność dydaktyczna Oddziału jest prowadzona w oparciu o programy edukacyjne dla dzieci niepełnosprawnych, dostosowane indywidualnie do możliwości i potrzeb dziecka, każdorazowo konsultowane i zatwierdzane przez jego rodziców.

Zadaniem Oddziału Wczesnego Wspomagania Rozwoju Dzieci z Autyzmem i Pokrewnymi Zaburzeniami w szczególności jest:
- organizacja i prowadzenie form oddziaływań terapeutycznych dla dzieci z autyzmem,
- organizowanie działań integracyjnych i pomocy terapeutycznej dla dzieci z autyzmem będących pod stałą opieką Oddziału,
- działalność wspierająca rodziny,
- szkolenie pracowników Oddziału, rodziców, studentów i innych osób zainteresowanych,
- działalność popularyzatorska dotycząca terapii autyzmu i zaburzeń pokrewnych,
- utrzymywanie kontaktów i współpraca z osobami, ośrodkami, instytucjami, stowarzyszeniami w Polsce i za granicą zajmującymi się problemami autyzmu.